Ο Διοσκουρίδης συνιστά το αφέψημα των κορυφών του φυτού κατά των κοιλιακών νοσημάτων, κατά των άφθων, για την στερέωση των ούλων (με το μάσημα των φύλλων), και κατά των κονδυλωμάτων και των αιμορροΐδων σε καταπλάσματα.Στη σύγχρονη βοτανοθεραπεία τα φύλλα του  Βατόμουρου χρησιμοποιούνται για την αντιμετώπιση διαταραχών του γαστρεντερικού συστήματος. Οι τανίνες που περιέχει το βότανο (8 -14% gallotanines) έχει διαπιστωθεί πως συμβάλουν αποφασιστικά και αποτελεσματικά στην αντιμετώπιση κάθε μορφή διάρροιας. Με τη μορφή στοματικής πλύσης, το βατόμουρο  θεωρείται ιδιαίτερα αποτελεσματικός σε περιπτώσεις στοματικών μολύνσεων. Τα φύλλα του βατόμουρου περιέχουν πλήθος ενεργών συστατικών, όπως κιτρικά και ισοκιτρικά οξέα καθώς και φλανοειδή.